
1. La isla, como puede verse cuando quita el "tapón" es el contenedor de la legendaria "fuente de la vida" que mantiene el mundo en pie, además de el origen y el fin de todo lo conocido en este mundo; también es una puerta entre este mundo y el mundo de las tinieblas (ojo que parece como una especie de crater o como una "puerta al infierno") que hay que mantener vigilada y cerrada, por eso mientras haya "luz" todo esta bien, pero si se extingue puede desatarse el caos. Jacob y su "madre" ya lo dijeron muy claramente, es la luz de todo.
2. Jacob explicó que necesitaba a alguien para sustituirle, por cansancio y/o porque sabía que se acercaba su final. Jacob cometió muchos errores en su vida y lo sabía, como lo de su hermano, o como bien dice Ben, al establecer sus reglas, reglas que Hugo podía re-establecer o cambiar, cosa que seguramente ha

3. Todos cumplen su papel, estaban predestinados a vivir la etapa mas importante de sus vidas en y por la isla, algunos viven y otros mueren: los que viven continúan con sus vidas, dentro o fuera de la isla.

Muchos años mas tarde, cuando ya todos han muerto, construyen un mundo en la otra vida (o el limbo) donde poder reencontrarse y emprender juntos el viaje a la eternidad, como bien dice el padre de Jack "con la gente mas importante que has tenido en vida". (de ahí que Kate, que se supone vivió toda una vida despues de la isla, le dice a Jack que lo había extrañado mucho tiempo). Observad también que Hugo le agradece a Ben por haber sido tan buen número 2, señal de que igualmente ambos vivieron sus vidas en la isla largo tiempo.
Estas son mis teorías, os pueden gustar o no, os parecerán buenas o malas, pero este es mi blog y hago y digo lo que me de la gana, si queréis uno, arriba, a la derecha, le dáis a "acceder" y os creáis uno y me ponéis verde si queréis (modo divagaciones idiotas propias de la falta de sueño ON).
Para mi, todo está muy claro, puede quedar algún cabo suelto, pero todas las piezas están en la mesa, solo hay que encajarlas y verlo. Eso de "todos están muertos al final" sería caer en la explicación facil.
Por cierto, se admiten teorías.

Enlaces de interés para entender mejor este final:
http://blogs.formulatv.com/hostiletakeover/claridad-y-distincion-desenredamos-el-final-de-lost/
http://www.elpilotoautomatico.es/2010/05/24/%C2%BFque-ha-pasado-en-lost/